多肽疫苗分為3大類:

1、抗病毒相關多肽疫苗，包括HBV、HIV、呼吸道合胞病毒等；

2、抗腫瘤相關多肽疫苗，包括腫瘤特異性抗原多肽疫苗、癌基因和突變的抑癌基因多肽疫苗；

3、抗細菌及寄生蟲感染的多肽疫苗，如結核桿菌短多肽疫苗、血吸蟲多抗原多肽疫苗和惡性瘧疾的CTL表位多肽疫苗。

多肽疫苗具有安全、容易制備、特異性強、易于保存和應用的特點。

多肽疫苗在臨床實驗中的安全性、免疫原性和抗癌 效果事必須考慮的問題。首先，任何誘發免疫反應的嘗試，尤其事對于那些弱抗原，如果癌癥患者的免疫系統已經被抑制，那將是無用的。而許多傳統的第二線抗癌治療，比如說化療和放療可能有很高的免疫抑制。因此，服用任何種類的多肽疫苗，免疫系統從上述治療所引起的效應中復原事重要的。因此通過以下方法增強多肽疫苗的免疫原性和穩定性。1抗原肽必須與適當的佐劑配合，以促進他們向DC傳遞，同時活化APC，觸發T細胞應答。2肽段與MHC分子結合的親和力事引起免疫應答的決定因素。所以可以置換氨基酸殘基提高與MHC分子親和力。3、修飾空間結構，模擬天然表位構象。4、使用DC多肽疫苗。5、化學修飾肽段增加穩定性。

多肽疫苗克服了傳統疫苗的許多缺點，可大規模化學合成，易于純化，在人體應用在非常安全。如果在短肽上鏈接一些化合物制備成內在佐劑，可大大提高免疫效應。另外制備多價疫苗，接種后可同時預防多種疾病。尤其在腫瘤治療中應用廣泛，可降低由放療、化療帶來的巨大副作用，對腫瘤細胞具特異性殺傷。這些特點都預示著多肽疫苗可能是疫苗學的發展方向。

1、MHC-是所有編碼生物相容復合體抗原的基因群一種統稱，表示可以進行MHC 基因家族（MHC classⅠ,class Ⅱ,class Ⅲ）編碼而成分子，即MHA，的基因。MHA位于細胞表面，主要功能是綁定由病原體衍生的肽鏈，在細胞表面顯示出病原體，以便于T-細胞的識別并執行一系列免疫功能（例如殺死已被病菌感染的細胞，激活巨噬細胞殺死體細胞內細菌，激活B細胞產生抗體等）。

2、抗原表位，又稱抗原決定簇或抗原決定基（antigenic determinant，AD）指抗原分子中決定抗原特異性的特殊化學基團。抗原通過抗原表位與相應的淋巴細胞表面的抗原受體結合，從而激活淋巴細胞，引起免疫應答

3、CTL:細胞毒性T淋巴細胞（cytotoxic lymphocyte,CTL），是白細胞的亞部，為一種特異T細胞，專門分泌各種細胞因子參與免疫作用.對某些病毒、腫瘤細胞等抗原物質具有殺傷作用，與自然殺傷細胞構成機體抗病毒、抗腫瘤免疫的重要防線。

4、DC是已知機體內抗原呈遞能力最強的細胞，通過對腫瘤抗原的攝取和抗原提呈，可以有效的誘導及活化免疫效應細胞，從而介導強大的特異性腫瘤免疫。