我們建議在溶解之前用蒸餾水或無菌水進行小試，對于較短的寡肽（小于5aa）常常能夠直接溶解。對于其他的多肽，大多需要根據多肽的序列優化溶解條件，并測試幾種不同的溶劑，直至找到最優方法（超聲處理有助于打碎顆粒，增加溶解度）。

多肽的極性對溶解度有很大的影響：酸性的蛋白易溶解于堿性溶液，而酸性溶液則適合堿性蛋白。

可以用下表氨基酸的酸堿度值的加和來計算多肽的酸堿度：

氨基酸名稱 酸堿度賦值

按上述原則，得分大于0為堿性多肽，得分小于0的為酸性多肽，得分為0為中性多肽。

舉例說明:

RKDEFILGASRHD: (+5) + (-4) = +1 認為是堿性多肽

EKDEFILGASEHR: (+4) + (-5) = -1 認為是酸性多肽

AKDEFILGASEHR: (+4) + (-4) = 0 認為是中性多肽

1. 對于堿性多肽，如果純水無法溶解，請嘗試10% - 30%的醋酸；如果多肽還是不溶，測試純醋酸和三氟乙酸TFA(<50 μl)來溶解，然后將多肽溶液稀釋到需要的濃度。

2. 對于酸性多肽，如果純水無法溶解，請嘗試13% 氨水（v/v）來溶解，并稀釋至所需濃度。如果多肽序列中包含半胱氨酸Cys（C），不能用氨水溶解，需使用二甲基甲酰胺（DMF）或N-甲基吡咯烷酮 (NMP)進行溶解。對于容易聚集的多肽，則選擇6M的胍鹽酸（guanidine?HCl）或8M的尿素（Urea）來溶解，然后稀釋到需要的濃度。

3. 中性多肽應選用機溶劑來溶解。首先，嘗試使用乙腈 （acetonitrile） ，或甲醇 （methanol） 或異丙醇 （isopropanol）進行溶解；對于疏水性非常強的多肽，先用少量的二甲基亞砜（DMSO）溶解，并用水稀釋到需要的濃度。同理，如果多肽序列中包含半胱氨酸Cys（C），需使用二甲基甲酰胺（DMF）或N-甲基吡咯烷酮 (NMP)進行溶解。對于容易聚集的多肽，則選擇6M的胍鹽酸（guanidine?HCl）或8M的尿素（Urea）來溶解，然后稀釋到需要的濃度。

問: 如何保存多肽?

答: 1. 為了方便儲存及后續使用，建議將多肽溶解至濃度為1-2 mg/ml左右。

2. 為了防止或盡量減少多肽降解，請將多肽以凍干粉形式保存在-20°C，-80°C更佳。如果需要保存溶液肽，最好分成小樣存放，以避免反復凍融。一份樣品融凍后未用完，應扔掉。細菌降解有時會成為溶液肽的麻煩，所以請將肽溶于無菌水或肽溶液過濾除菌。

3. 多肽序列中含有甲硫氨酸Met（M），半胱氨酸Cys（C）或酪氨酸Tyr（Y），建議保存于無氧環境防止氧化。

問: 如何選擇適合自己研究的多肽純度?

答: 粗品肽不推薦用于生物實驗。粗肽可能含有大量的非肽類雜質，如殘留的有機溶劑、清除劑、TFA和其他不完整肽。TFA不能被完全消除，通常交付的肽以TFA鹽的形式存在。如果殘留的TFA影響您的實驗，我們推薦其他鹽形式，如醋酸鹽和鹽酸鹽等。這些鹽通常比常規TFA鹽貴20-30%以上。這是由于在轉化過程中出現更多的肽損失和需要更多的原材料。

NovoPro建議對各種項目采用以下級別的肽純度：